自然界某些野生動物中能長期保存某種傳染病病原體的地區。這些疾病的病原體不需要人類的參與，能夠延續世代，造成動物病流行，並在一定條件下傳染給人，造成人間流行。這類疾病稱為自然疫源性疾病，如鼠疫、森林腦炎、恙蟲病、鉤端螺旋體病等。自然疫源地有顯著的地區性特性。不同疾病的自然疫源地有其獨特的景觀類型，因此地理景觀往往是識別和劃分自然疫源地的一個重要標誌。自然性性疾病呈現季節性，如媒介昆蟲傳播。人類經濟活動對自然疫源疾病有明顯的影響，如植樹造林改良生態環境，能有效地控制疾病的流行與傳播。掌握自然疫源地的分佈規律，可以對這些疾病的發生進行預測預報，以便預防和控制這些疾病的傳播。