中國衛生部直屬的預防醫學科研機構。1983年由原屬中國醫學科學院的5個研究所和衛生部直屬的工業衛生實驗所劃出組成。原名中國預防醫學中心，1986年改為現名。後工業衛生實驗所複歸衛生部直接領導。該院現有8個研究所，即流行病學微生物學研究所、病毒學研究所、寄生蟲病研究所、勞動衛生與職業病研究所、環境衛生與衛生工程研究所、營養與食品衛生研究所、環境衛生監測所和食品衛生監督檢驗所。現有科技人員1 800人，研究員和副研究員約占科技人員的222％。研究工作重點為嚴重危害人民健康的傳染病、寄生蟲病、職業病、地方病、食物中毒、非傳染病如腫瘤等的預防及控制以及有關室內外環境、工作環境、營養等方面公共衛生問題。在國內首先采用基因工程研制出多種人幹擾素，並將生物技術應用於疫苗研制和多種疾病的診斷。全院有5個世界衛生組織合作中心，1個國傢級病毒基因工程實驗室，建立瞭全國病毒診斷中心、艾滋病監測中心。創辦雜志11種，如《中華流行病學》雜志和《病毒學報》。