由肉足鞭毛亞門動鞭毛蟲綱所屬原蟲寄生所引起的疾病。中國主要有寄生於馬、牛、駱駝血液的伊氏錐蟲、寄生於馬生殖器官的媾疫錐蟲(見錐蟲病)、寄生於犬的皮膚和內臟的杜氏利什曼蟲、寄生於牛生殖器官的牛胎毛滴蟲和寄生於禽類盲腸和肝臟的鞭毛組織滴蟲等，對畜牧業生產為害嚴重。鞭毛蟲的共同形態特徵是具有1～8條或更多的鞭毛作為運動器官，以鞭毛遊離端的圓圈狀振動而運動。蟲體由原生質、若幹個核以及其他構造物如軸柱、胞口、波動膜等組成。行縱分裂增殖。除媾疫錐蟲、牛胎毛滴蟲是由病畜畜與健畜之間交配時感染外，其他各種鞭毛蟲都由吸血昆蟲或蠕蟲作媒介而傳播。主要采取綜合措施防治，包括早期發現病畜、及時隔離、應用藥物防治以及消滅媒介昆蟲等。