為確保安全有效地用藥而規定在用藥期間所禁止和註意的事項。包括配伍禁忌、證候禁忌、妊娠禁忌和飲食禁忌。
配伍禁忌 即在配伍用藥時應避免有些藥物一起使用，以免降低、破壞藥效或產生劇烈的毒副作用。十八反和十九畏所包括的藥物即屬配伍禁忌的藥物。
證候禁忌 指某種藥物對某些病證有害而應禁忌。如麻黃辛溫，發發散風寒，宣肺平喘，適用於外感風寒，肺氣不宣，氣喘咳嗽，若呼多吸少，攝納無權，肺腎虛喘者，則忌用。除極少數藥性和平的藥物外，一般藥物多有證候禁忌。
妊娠禁忌 某些藥物有損害胎元、影響胎兒發育或引起流產等毒副作用，屬於妊娠禁忌。根據藥物對胎兒及母體損害程度的不同，可分為禁用與慎用兩類。①禁用藥：多屬於毒性較強或藥性猛烈的藥物，一般不能使用。如巴豆、商陸、千金子、芫花、雄黃、砒霜、鉛丹、硫黃、硇砂、烏頭、附子、關白附，幹漆、水蛭、虻蟲、麝香等。②慎用藥：多屬於通經祛瘀、破滯行氣、滲泄滑利、辛熱燥烈、鎮降或湧吐等類藥物，一般應盡量避免應用，非用不可時，須酌情使用。如當歸尾、蘇木、桃仁、紅花、蒲黃、五靈脂、沒藥、牡丹皮、穿山甲、王不留行、馬鞭草、皂角刺、劉寄奴、三棱、莪術；大黃、芒硝、鬱李仁、枳實、厚樸、檳榔、鬱金；瞿麥、白茅根、木通、通草、薏苡仁、滑石、葶藶子；幹薑、肉桂、半夏、天南星、皂莢、代赭石、牛黃、瓜蒂、膽礬、槐花、蟬衣等。
飲食禁忌 指服藥期間應禁忌某些食物。又稱食忌、忌口。食物與藥物同樣有防治疾病的作用。因此，除平時根據體質及季節進行調養外，患病期間尤當註意飲食禁忌，以免食物與藥物性能相拮抗，抵消治療作用；也避免食物性能與疾病性質相抵觸，而使病情惡化。《靈樞·五味篇》中有“肝病禁辛、心病禁咸、脾病禁酸、腎病禁甘、肺病禁苦”的記載。飲食禁忌總的原則是忌食生冷、油膩、腥膻及有刺激性的食物。根據病情不同，飲食禁忌又有區別。如寒性疾病忌食瓜果生冷食物；熱性疾病忌食辛辣油膩食物；虛性疾病禁食清泄寒滑食物；實性疾病禁食溫補固澀食物；肝陽上亢、煩躁眩暈者忌食胡椒、辣椒、大蒜、白酒等辛熱助陽之品；胸痹心痛者忌食肥肉、動物內臟等油膩高脂食物；肺癆咳血、肺癰吐膿者忌食辛辣燥烈刺激性食物；消化不良，脾胃虛弱者忌食油炸粘膩、寒冷固硬、不易消化的食物；濕熱黃疸、脅痛口苦、濕熱泄痢者忌食肥肉油膩生冷食物；腎病水腫者忌食鹽、堿太多和酸辣太過的食物；口腔糜爛者忌食油炸及炒花生、瓜子等香燥食物；痔瘡、肛裂者忌食辛辣刺激性食物；瘡瘍、風疹、濕疹等皮膚病及過敏性哮喘、紫癜等病者忌食魚、蝦、蟹、豬頭肉、豬蹄、雞、鵝、羊、韭菜、芥菜等發物。此外，古代文獻記載：甘草、黃連、桔梗、烏梅忌豬肉；薄荷忌鱉肉；丹參、茯苓、茯神忌醋；鱉甲忌莧菜；常山忌蔥；地黃、何首烏忌蔥蒜、蘿卜；土茯苓、使君子忌茶；蜜反生蔥；柿反蟹等。均應作為飲食禁忌的參考。
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