各級銀行機構相互委託或代理收付款項形成的資金佔用額。各銀行根據當天聯行往來各有關科目收付額軋抵，如收入多於付出形成應付匯差，付出多於收入則形成應收匯差。
隻要銀行機構發生委託或代理收付款，就會產生匯差，就要有匯差清理辦法。中國的聯行資金清算制度自1979年經濟體制改革以來進行過三次變革。第一次是在1981年，為瞭改變對匯差資金不清算、不計息，參加聯行往來各行共同擠佔聯行清算資金的狀況，中國人民銀行、中國農業銀行和中國銀行行三傢總行商定，匯差資金必須每天清算並按季節計算利息。第二次是為瞭使中國人民銀行和專業銀行的資金嚴格分清，防止專業銀行利用聯行往來擠占中國人民銀行資金，1985年4月1日起，中國人民銀行和各專業銀行的聯行改為“自成聯行系統，跨行直接通匯，相互發報移卡，及時清算資金”。第三次是自1987年4月1日起停止實行跨行直接通匯、相互發報移卡的做法，改為專業銀行對跨行匯劃款項，一律實行“相互轉匯”的做法，即“聯行仍然分開，跨行相互轉匯，及時移證發報，堅持錢帳兩清”，要求跨行匯劃款項與資金清算同步進行，變事後清算為同步清算。但這一做法增加瞭轉匯的環節，不利於社會資金加速周轉，有待進一步改進。
聯行匯差能否及時清算，同銀行機構的企業管理程度有關。銀行機構的企業化管理程度高，有及時清算的動力，就能及時清算；如企業化管理程度很低，被欠者不積極催收，欠款者不怕信用受損，無論怎樣規定清算制度，也難免出現匯差拖欠。而出現不合理的匯差拖欠，又會沖擊各行或各地區之間原有信貸資金分配比例，反過來又損害有關銀行機構的企業化管理。