由真菌、線蟲、細菌引起的植物病害。被害植株根部腐爛甚至壞死，病株枯死。真菌如腐黴(Pythium)、疫黴(Phytophthora)、絲核菌（Rhizoctonia）、鐮刀菌(Fusarium)、核盤菌（Sclerotinia）等為主要病原物。致病線蟲主要是短短體線蟲屬(Pratylenchus)。專致根腐病的細菌極少。主要的根腐病有小麥全蝕病，甜菜根腐病、菜豆根腐病、細辛根腐病等。病因復雜，常由2～3種病菌或2種不同類別的病原物共同引起。環境條件適宜時，病株還易被一些腐生性強的病原物再侵入，加速根部腐爛，造成復合癥狀。病菌主要在土壤內或遺留在土壤內的病殘組織上越冬，熱帶、亞熱帶地區的根腐病菌在土壤中可終年以菌索不斷蔓延為害。根腐病是土傳病害，主要通過土壤內水分、地下昆蟲和線蟲傳播。可采取輪作、抗病育種、加強田間管理、果園內挖溝切斷菌源和土壤消毒等措施，以進行綜合防治。嚴重病區實行植物檢疫。