對系統設計、系統實施和系統運行等各項活動進行有效的監督和控制，以求系統能達到預期的性能要求。為瞭保證系統設計的完整性，系統管理過程必須貫穿於系統存在的各個階段。系統管理涉及對系統的進度、成本和人力的控制。為瞭更好地管理整個系統的進度，可以採用任務分解結構和計畫協調技術。前者是對整個系統逐層劃分任務專案，直到最低層不可再分的任務單元為止，一般分解成一種樹形結構圖。根據這個樹形結構所規定的任務進一步制定按時間劃分的系統進度表，並可進一步採用計畫協調技術檢查和協協調系統研制的進度。這樣使主管部門能直觀地看到各項工作應在何時完成，還可以根據各種任務決定專傢和技術人員的合理配置，並定期檢查，以便隨時對工作情況進行估計和協調。在管理大系統時需要各種數據信息，這時往往需要建立管理信息系統，它能正確而及時地提供各種數據，並且能進行分析綜合，以便向各有關單位提供有益的綜合信息。為瞭領導部門在各種復雜情況下能夠作出較好的決策，現在還發展瞭決策支持系統。系統管理一般由管理人員、組織機構和監控手段三部分組成。管理的好壞涉及人的因素。要對全體人員進行合理的組織、規劃、選擇、管理、指導以至獎懲等。管理中要強調各自的職責，要有明確的條例和指令通過一定的指揮渠道及時地傳給各個崗位，並要加強各方面的信息交流，相互協調。